O desempenho ruim da equipe nos últimos jogos pesou pela saída. A direção do clube esperava uma melhora no nível da equipe após o período de treinos que se seguiu à eliminação precoce nas quartas de final do Paulista, para o Água Santa.
O técnico viveu altos e baixos, sendo o principal auge a final da Copa Sul-Americana do ano passado. Além da queda no Paulistão, em 2023 o São Paulo teve um desempenho ruim no empate sem gols contra o Ituano, pelo jogo de ida da terceira fase da Copa do Brasil, e começou o Brasileirão com tropeço para o Botafogo.
Além dos resultados e desempenhos, Ceni passou a ter uma relação desgastada com alguns jogadores e com a própria diretoria. A briga entre o treinador e Marcos Paulo mexeu com o elenco e deixou um ambiente mais conturbado.