As quartas de final começam no próximo sábado (26) com dois confrontos: a Ferroviária recebe o Sousa, em Araraquara, enquanto o Bahia de Feira será o anfitrião diante do Athletic, em Feira de Santana. No dia seguinte serão disputados mais dois jogos: o Maranhão recebe o Ferroviário, enquanto o Caxias encara a Portuguesa, em casa.
No fim de semana seguinte (dias 2 e 3 de setembro) os mandos de campo serão invertidos. No sábado (2) o Ferroviário recebe o Maranhão, enquanto o Athletic mede forças com o Bahia de Feira, em casa. No domingo há mais dois duelos: o Sousa enfrenta a Ferroviária e a Portuguesa recebe o Caxias.Os confrontos das quartas foram definidos de acordo com a ordem das campanhas ao longo da competição. Por exemplo, o Ferroviário, ainda invicto após 18 jogos (13 vitórias e cinco empates), tem o melhor retrospecto e, por isso, encara o Maranhão, que fez a oitava melhor campanha entre os oito classificados. No entanto, o retrospecto passado não dá ao time melhor ranqueado nenhuma vantagem além do fato de decidir a classificação em casa. Caso qualquer um dos duelos termine igual ao final dos 180 minutos, a vaga na semifinal, e consequentemente na Série C de 2024, será definida nas penalidades máximas.